Korkeasaari tekee yhteistyötä monien eri korkeakoulujen ja oppilaitosten kanssa sekä koti- että ulkomailla. Vuosittain Korkeasaaressa käy myös monien eri alojen opiskelijoita ja opinnäytetöiden tekijöitä tekemässä tutkimuksiaan ja Korkeasaaresta toimitetaan pyydettäessä tutkimus-materiaalia hyvin monenlaisia selvitystöitä varten. Opinnäytetöiden aiheina ovat olleet mm eläinlääketiede, eläinten käyttäytymistiede ja logistiikka. Valitettavasti emme voi ottaa vastaan lyhytaikaisia harjoittelijoita emmekä työelämään tutustuvia koululaisia.
Korkeasaarella ja Helsingin yliopistolla on perustettu yhteistyötä kehittämään neuvottelukunta. Neuvottelukunta tekee aloitteita tutkimus- ja opetusyhteistyöhön. Korkeasaaressa on mm. järjestetty lajien suojeluun, eläinlääkintään ja ympäristökasvatukseen liittyviä yliopisto-kursseja ja opintokäyntejä.
Korkeasaari on suosittu päättöharjoittelupaikka sekä pien- että tarhaeläinopiskelijoille. Monipuolisen lajivalikoiman vuoksi tarhaeläinhoitajien näyttötutkinnon on toistaiseksi voinut suorittaa vain Korkeasaaressa. Oppisopimus-oppilaita ei eläintenhoitoon nykyisellään voida ottaa.
Korkeasaaren markkinointi tekee yhteistyötä eri oppilaitosten kanssa koko luokan oppimisprojekteina mm. yleisötapahtumien tuotannoissa. Lisäksi markkinointi on tarjoaa aiheita opinnäytetöiksi ja työharjoittelu-mahdollisuuksia esim. medianomi-, tradenomi- ja graafisen alan opiskelijoille. Tarkkaile avoinna olevia harjoittelupaikkoja osoitteessa
www.jobstep.net tai laita avoin hakemus ansioluettelon kera
zoo.markkinointi(at)hel.fi.
Korkeasaarella on ollut yli kymmenen vuoden ajan kummikouluna Kallahden peruskoulu. Kummikoulujen kanssa pyritään pitkäaikaiseen yhteistyöhön, jossa voidaan niin syventää oppilaiden biologian tietämystä kuin kokeilla uusia opetustapoja ja materiaaleja.
Syksystä 2008 lähtien Korkeasaari hakee uusia kouluja ja opettajia, jotka ovat kiinnostuneita kummiyhteistyöstä.